A nivel nacional el IGM colabora con otros organismos públicos en el ámbito de su propio quehacer, manteniendo contactos y relaciones directas que buscan fortalecer su misión institucional, pudiendo mencionar:
Asimismo, el IGM como organismo plenamente comprometido con el desarrollo nacional, colabora con numerosas instituciones tanto académicas como privadas mediante el apoyo y asesorías en aquellas materias geodésicas, cartográficas y geográficas que sean requeridas. Esta colaboración se materializa mediante el establecimiento de convenios de cooperación de mutuo beneficio, entre los que se encuentran: